| 問題 | 潛在原因 | 建議的解決方案 | 
| 弱染色或無染色 
   
   | 抗體濃度過低 | 嘗試增加一抗濃度考慮使用使用生物素化二抗的擴增系統
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| 抗體不相容性 |  | 
| 高背景會模糊信號 |  | 
| 膜被透化試劑損壞 |  | 
| 抗體不適合 IHC |  | 
| 目標蛋白豐度低 | 嘗試增加一抗濃度嘗試使用放大方法,例如生物素化二抗
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| 固定可能會掩蓋目標表位 |  | 
| 抗體對組織切片的滲透性較差 |  | 
| 通透性不足 |  | 
| 與檢測系統使用不兼容的二級熒光團 |  | 
| 安裝后熒光團降解 |  | 
| 緩沖區退化 | 使用前檢查緩沖液的 pH 值警惕細菌生長的跡象,一旦發現就扔掉。必要時新鮮制作。
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| 降解的一抗 |  | 
| 由于光漂白而損壞熒光團共軛二抗 | 確保使用熒光團共軛二抗時執行的所有步驟都是在弱光或黑暗中進行成像時盡量使用盡可能低的照明來捕獲最佳圖像。這對于共焦顯微鏡尤其重要,因為高激光功率設置可以極快地漂白一些熒光團。考慮使用比 FITC 或 TRITC 等舊化合物更耐漂白的熒光團。
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| 不兼容的緩沖區 |  | 
| 過度固視 | 嘗試減少組織與固定劑一起孵育的時間。考慮嘗試替代固定液
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| 多路復用時在通道之間滲透 | 重疊的熒光團激發/發射光譜 | 嘗試使用重疊有限的熒光團對(例如DAPI、Alexa Fluor 488 和 Alexa Fluor 594)使用光譜分析工具(例如FPbase Spectraviewer)確保熒光團對之間的重疊有限。嘗試使用單一抗體對照,看看一個通道中的信號是真實的還是只是由于滲漏所致。一些先進的圖像分析軟件具有可以(在一定程度上)校正滲色的功能。
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| 成像系統上的激發和發射濾光片不合適 |  | 
| 組織形態改變 | 冰傷害 |  | 
| 自由浮動部分的粗暴處理 | 使用網等設備可以幫助減少整個協議中組織切片所需的處理量。使用優質細畫筆拾取和移動部分。確保沒有被低溫恒溫器/切片機刀片降解。安裝自由浮動部分時,盡量避免接觸部分,而是使用刷子飄到載玻片上。
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| 因儲存不當而降解 |  | 
| 抗原修復過于苛刻 |  | 
| 冰凍切片從載玻片上脫落 |  | 
| 固定不佳 |  | 
| 高背景或非特異性染色 
   | 組織切片中的自熒光分子 | 如果組織尚未灌注,請考慮在下一個實驗中進行,因為剩余的紅細胞會產生強烈的自發熒光。自發熒光可能是由固定劑引起的。嘗試使用不同的固定劑。確保 NaBH 4是新鮮制備的嘗試用淬滅熒光的染料(例如,Pontamine 天藍、蘇丹黑或臺盼藍)孵育切片。嘗試使用與自發熒光波長不同的熒光團(例如紅移染料,如 Alexa Fluor 680) 
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| 非特異性二次結合 |  | 
| 一抗濃度過高 |  | 
| 二抗濃度過高 |  | 
| 抗體純化不充分 | 未純化的多克隆抗體可能含有與一系列非靶蛋白發生交叉反應的抗體。檢查數據表;理想情況下,應使用免疫原作為誘餌,通過親和層析純化多克隆抗體。 雖然單克隆抗體的問題較少見,但仍應至少使用 Protein A 或 G 親和層析進行純化。如果有其他替代品,請考慮改用更好的純化抗體,或者如果沒有其他替代品,請考慮內部純化抗體。  
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| 阻擋不足 | 確保封閉血清與培養二抗的物種相同。嘗試使用不同的阻塞解決方案。嘗試增加封閉步驟的長度或增加血清濃度
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| 洗滌不足 |  | 
| 一抗與組織切片來自同一物種。 |  | 
| 內源酶活性(用于顯色檢測) | 對于 HRP 結合二抗,使用 0.3% H 2 O 2 10-15 分鐘。如果在此濃度下封閉不成功,請考慮增加至 3%。  對于 AP 結合二抗,請使用 2mM 左旋咪唑。    | 
| 部分已經干了 |  | 
| 底物過多(用于顯色檢測) |  | 
| 信號放大率過高(如果使用生物素化二抗) | 嘗試降低擴增試劑或二抗的濃度。考慮信號放大是否必要或者標準方法是否有效。
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| 組織切片厚度 |  |